冬蟲夏草菌之子座出自寄主幼蟲的頭部，單生，細長呈棒球棍狀，長4－14厘米，不育頂部長3－8厘米，直徑1．5－4厘米;上部為子座頭部，稍膨大，呈窄橢圓形，長1．5－4厘米，褐色，除先端小部外，密生多數子囊殼，頂部不育部長1．5－5．5毫米;子囊殼近表面生基部大部陷入子座中，先端凸出于子座外，卵形或橢圓形，長250－500微米，直徑80－200微米，每一個子囊內有8具有隔膜的子囊孢子。蟲體表面深棕色，斷面白色;有20－30環節，腹面有足8對，形略如蠶。