公司必須首先提交變更報告書，包括變更的目的及變更的具體內容，經股東大會審批、備案，再向工商行政管理部門辦理變更登記，否則被視為違法。公司發生分立或合并以后，無論是繼續存在的存續公司，還是合并以后的新設公司，都會發生業務職能的變更，都需要變更公司章程。業務職能變更和公司組織變更是同一變更過程的兩個方面。
公司變更注冊資本的，應當提交依法設立的驗資機構出具的驗資證明。公司增加注冊資本的，有限責任公司股東認繳新增資本的出資和股份有限公司的股東認購新股，應當分別依照公司法設立有限責任公司繳納出資和設立股份有限公司繳納股款的有關規定執行。股份有限公司以公開發行新股方式或者上市公司以非公開發行新股方式增加注冊資本的，還應當提交證券監督管理機構的核準文件。公司法定公積金轉增為注冊資本的，驗資證明應當載明留存的該項公積金不少于轉增前公司注冊資本的25%。
公司減少注冊資本的，應當自公告之日起45日后申請變更登記，并應當提交公司在報紙上登載公司減少注冊資本公告的有關證明和公司債務清償或者債務擔保情況的說明。
公司變更實收資本的，應當提交依法設立的驗資機構出具的驗資證明，并應當按照公司章程載明的出資時間、出資方式繳納出資。公司應當自足額繳納出資或者股款之日起30日內申請變更登記。
變更注冊資本要先做《驗資報告》。
分立合并
因合并、分立而存續的公司，其登記事項發生變化的，應當申請變更登記；因合并、分立而解散的公司，應當申請注銷登記；因合并、分立而新設立的公司，應當申請設立登記。
公司合并、分立的，應當自公告之日起45日后申請登記，提交合并協議和合并、分立決議或者決定以及公司在報紙上登載公司合并、分立公告的有關證明和債務清償或者債務擔保情況的說明。法律、行政法規或者決定規定公司合并、分立必須報經批準的，還應當提交有關批準文件。 [3]
依照《公司法》第22條規定，如果公司股東會或者股東大會、董事會的決議無效，或者被人民法院撤銷的，而公司根據上述決議已經辦理了變更登記，則在人民法院宣告上述決議無效或者撤銷上述決議后，公司應當向公司登記機關申請撤銷變更登記。 [2]
公司申請撤銷變更登記時應當提交下列文件：(1)公司法定代表人簽署的申請書；(2)人民法院關于宣告決議無效或撤銷決議的裁判文書。