煤炭司 擬訂煤炭開發、煤層氣、煤炭加工轉化為清潔能源產品的發展規劃、計劃和政策并組織實施，承擔煤炭體制改革有關工作，協調有關方面開展煤層氣開發、淘汰煤炭落后產能、煤礦瓦斯治理和利用工作。
法制和體制改革司 研究能源重大問題，組織起草能源發展和有關監督管理的法律法規、規章送審稿，承擔有關規范性文件的合法性審核工作，承擔行政執法監督、行政復議、行政應訴等工作，承擔能源體制改革有關工作。
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電力監管司 組織擬訂除核外的電力運行、電力建設工程施工、工程質量監督管理辦法的政策措施并監督實施，承擔電力生產監督管理、可靠性管理和電力應急工作，負責水電站大壩的監督管理，依法組織或參與電力生產事故調查處理。 國際合作司 組織推進能源國際交流與合作，按分工承擔同外國能源主管部門和國際能源組織談判并簽訂協議有關工作，擬訂能源對外開放戰略、規劃及政策，協調境外能源開發利用。