負責起草能源發展和有關監督管理的法律法規送審稿和規章，擬訂并組織實施能源發展戰略、規劃和政策，推進能源體制改革，擬訂有關改革方案，協調能源發展和改革中的重大問題。
法制和體制改革司 研究能源重大問題，組織起草能源發展和有關監督管理的法律法規、規章送審稿，承擔有關規范性文件的合法性審核工作，承擔行政執法監督、行政復議、行政應訴等工作，承擔能源體制改革有關工作。
發展規劃司 研究提出能源發展戰略建議，組織擬訂能源發展規劃、年度計劃和產業政策，參與研究全國能源消費總量控制工作方案，指導、監督能源消費總量控制有關工作，承擔能源綜合業務。 能源節約和科技裝備司 指導能源行業節能和資源綜合利用工作，承擔科技進步和裝備相關工作，組織擬訂能源行業標準（煤炭除外）。
綜合司 負責文電、會務、機要、檔案、督查、財務、資產管理等機關日常運轉工作，承擔政務公開、保密、信訪，以及能源行業統計、預測預警等工作，承擔國家能源委員會辦公室的綜合協調工作。