獨立性保函則不同，它雖是依據(jù)基礎(chǔ)合同開立，但一經(jīng)開立，便具有獨立的效力，是自足文件，擔保人對受舉益人的索賠要求是否支付，只依據(jù)保函本身的條款。
獨立性保函一般都要明確擔保人的責任是不可撤銷的、無條件的和見索即付的。保函一經(jīng)開出，未經(jīng)受益人同意，不能修改或解除其所承擔的保函項下的義務(wù)；保函項下的賠付只取決于保函本身，而不取決于保函以外的交易事項，銀行收到受益人的索賠要求后應(yīng)立即予以賠付規(guī)定的金額。見索即付保函就是獨立性保函的典型代表。
備用信用證作為信用證的一種形式，并無從屬性與獨立性之分，它具有信用證的“獨立性、自足性、純粹單據(jù)交易”的特點，受益人在該信用證為準，開證行只根據(jù)信用證條款與條件來決定是否償付，而與基礎(chǔ)合約并無關(guān)。
保函和備用信用證適用的法律規(guī)范和國際慣例不同。
由于各國對保函的法律規(guī)范各不相同的，到目前為止，尚未有一個可為各國銀行界和貿(mào)易界廣泛認可的保函國際慣例。獨立性保函雖然在國際經(jīng)貿(mào)實踐中有廣泛的應(yīng)用，但大多數(shù)國家對其性質(zhì)在法律上并未有明確規(guī)定，這在一定程度上阻礙了保函的發(fā)展。
在憑保函交付貨物的情況下，收貨人保證在收到提單后立即向船公司交回全套正本提單，承擔應(yīng)由收貨人支付的運費及其他費用的責任，對因未提交提單而提取貨物所產(chǎn)生的一切損失均承擔責任，并表明對于保證內(nèi)容由銀行與收貨人一起負連帶責任。憑保函簽發(fā)提單則使得托運人能以清潔提單、已裝船提單順利地結(jié)匯。關(guān)于保函的法律效力，海牙規(guī)則和維斯比規(guī)則都沒有作出規(guī)定，考慮到保函在海運業(yè)務(wù)中的實際意義和保護無辜的第三方的需要，漢堡規(guī)則次就保函的效力問題作出了明確的規(guī)定，保函是承運人與托運人之間的協(xié)議，不得對抗第三方，承運人與托運人之間的保函，只是在無欺騙第三方意圖時才有效；如發(fā)現(xiàn)有意欺騙第三方，則承運人在賠償?shù)谌綍r不得享受責任限制，且保函也無效。