物流運輸方式根據運輸工具的不同可分為多種方式,不同的運輸方式適合不同的貨物，常見的方式有海洋運輸、鐵路運輸、航空運輸、公路運輸、管道運輸、集裝箱運輸、國際多式聯運等。
公路運輸：
這是主要使用氣車，也使用其它車輛(如人、畜力車)在公路上進行貨客運輸的一種方式。公路運輸主要承擔近距離、小批量的貨運和水運、鐵路運輸難以到達地區的長途、大批量貨運及鐵路、水運優勢難以發揮的短途運輸。由于公路運輸有很強靈活性，近年來，在有鐵路、水運的地區，較長途的大批量物流運輸也開始使用公路運輸。
鐵路運輸：
這是使用鐵路列車運送客貨的一種運輸方式。鐵路運輸主要承擔長距離、大數量的貨運，在沒有水運條件地區，幾乎所有大批量貨物都是依靠鐵路，是在干線運輸中起主力運輸作用的運輸形式。
鐵路運輸優點是速度快，運輸不大受自然條件限制，載運量大，運輸成本較低。主要缺點是靈活性差，只能在固定線路上實現運輸，需要以其它運輸手段配合和銜接。鐵路運輸經濟里程一般在200公里以上。
水運：
這是使用船舶運送客貨的一種運輸方式。
水運主要承扭大數量、長距離的物流運輸，是在干線運輸中起主力作用的運輸形式。在內河及沿海，水運也常做為小型運輸工具使用，擔任補充及銜接大批量干線運輸的任務。
水運的主要優點是成本低，能進行低成本、大批量、遠距離的運輸。但是水運也有顯而易見的缺點，主要是運輸速度慢，受港口、水位、季節、氣候影響較大，因而一年中中斷運輸的時間較長。