（一）保函有從屬性保函和獨立性保函之分，備用信用證無此區(qū)分
保函作為人的擔(dān)保的一種，它與它所憑以開立的基礎(chǔ)合同之間的關(guān)系是從屬性亦或是獨立的關(guān)系呢？據(jù)此，保函在性質(zhì)上有從屬性保函和獨立性保函之分。傳統(tǒng)的保函是從屬性的，保函是基礎(chǔ)合同的一個附屬性契約，其法律效力隨基礎(chǔ)合同的存在、變化、滅失、擔(dān)保人的責(zé)任是屬于第二性的付款責(zé)任，只有當(dāng)保函的申請人違約，并且不承擔(dān)違約責(zé)任時，保證人才承擔(dān)違約責(zé)任時，保證人才承擔(dān)保函項下的賠償責(zé)任。而申請人是否違約，是要根據(jù)基礎(chǔ)合同的規(guī)定以及實際履行情況來作出判斷的，但這種判斷顯然不是件簡單的事，經(jīng)常要經(jīng)過仲裁或訴訟才能解決其中的是非曲直。所以當(dāng)從屬性保函項下發(fā)生索賠時，擔(dān)保人要根據(jù)基礎(chǔ)合同的條款以及實際履行情況來確定是否予以支付。各國國內(nèi)交易使用的保函基本上是從屬性質(zhì)的保函。
獨立性保函則不同，它雖是依據(jù)基礎(chǔ)合同開立，但一經(jīng)開立，便具有獨立的效力，是自足文件，擔(dān)保人對受舉益人的索賠要求是否支付，只依據(jù)保函本身的條款。
獨立性保函一般都要明確擔(dān)保人的責(zé)任是不可撤銷的、無條件的和見索即付的。保函一經(jīng)開出，未經(jīng)受益人同意，不能修改或解除其所承擔(dān)的保函項下的義務(wù)；保函項下的賠付只取決于保函本身，而不取決于保函以外的交易事項，銀行收到受益人的索賠要求后應(yīng)立即予以賠付規(guī)定的金額。見索即付保函就是獨立性保函的典型代表。
獨立性保函是二戰(zhàn)后為適應(yīng)當(dāng)代國際貿(mào)易發(fā)展的需要，由銀行和商業(yè)實踐的發(fā)展而逐步確立起來的，并成為國際擔(dān)保的主流和趨勢，原因主要在于：，從屬性保函的發(fā)生索賠時，擔(dān)保銀行須調(diào)查基礎(chǔ)合同履行的真實情況，這是其人員和專業(yè)技術(shù)能力所不能及的，且會因此被卷入到合同糾紛甚至訴訟中。銀行為自身利益考慮，絕不愿意卷入到復(fù)雜的合同糾紛中，使銀行的利益和信譽受到損壞，而趨向于使用獨立性保函。而且銀行在處理保函業(yè)務(wù)時，正越來越多地引進信用證業(yè)務(wù)的處理原則，甚至有的將保函稱為擔(dān)保信用證。第二，獨立性保函可使受益人的權(quán)益更有保障和更易于實現(xiàn)，可以避免保函申請人提出各種原因如不可抗力、合同履行不可能等等來對抗其索賠的請求，避免對違約人起訴所花費大量的金錢、精力及訴訟曠日持久等缺陷，可確保其權(quán)益不至因合同糾紛而受到損害。
備用信用證作為信用證的一種形式，并無從屬性與獨立性之分，它具有信用證的“獨立性、自足性、純粹單據(jù)交易”的特點，受益人在該信用證為準(zhǔn)，開證行只根據(jù)信用證條款與條件來決定是否償付，而與基礎(chǔ)合約并無關(guān)。
（二）保函和備用信用證適用的法律規(guī)范和國際慣例不同。
由于各國對保函的法律規(guī)范各不相同的，到目前為止，尚未有一個可為各國銀行界和貿(mào)易界廣泛認(rèn)可的保函國際慣例。獨立性保函雖然在國際經(jīng)貿(mào)實踐中有廣泛的應(yīng)用，但大多數(shù)國家對其性質(zhì)在法律上并未有明確規(guī)定，這在一定程度上阻礙了保函的發(fā)展。
保函手續(xù)費包括以下內(nèi)容：
1、支付保函手續(xù)費：銀行為客戶開立支付保函業(yè)務(wù)時，需要向客戶征收每季千分之五的保函手續(xù)費季，是500元每季。
2、履約保函手續(xù)費：銀行為客戶開立履約保函業(yè)務(wù)時，需要像客戶征收每季0.5%的保函手續(xù)費，指導(dǎo)度收取500元。
3、投標(biāo)保函手續(xù)費：銀行為客戶開立投標(biāo)保函業(yè)務(wù)時，需要像客戶征收每季0.5%的保函手續(xù)費，指導(dǎo)度收取500元。
4、分期付款與延期付款保函手續(xù)費：銀行為客戶開立分期付款、延期付款保函業(yè)務(wù)時，均需要像客戶征續(xù)費，指導(dǎo)價為0.15%，每季度收取500元。
5、關(guān)稅保函手續(xù)費：銀行為客戶開立關(guān)稅保函業(yè)務(wù)時，需要向客戶征收每季0.5%的保函手續(xù)費，指導(dǎo)度收取500元。
履約擔(dān)保書種類：
履約擔(dān)保書包括留置金擔(dān)保書、 預(yù)付款擔(dān)保書、 付款擔(dān)保書及租賃擔(dān)保書。
銀行履約保函形式分為兩種：
1、無條件銀行保函;
銀行見票即付，不需業(yè)主提供任何證據(jù)。業(yè)主在任何時候提出聲明，認(rèn)為承包商違約，而且提出的索賠日期和金額在保函有效期的限額之內(nèi)， 銀行即無條件履行保證，進行支付，承包商不能要求銀行止付。當(dāng)然業(yè)主也要承擔(dān)由此行動引起的爭端、仲裁或法律程序裁決的法律后果。
對銀行而言，他們愿意承擔(dān)這種保函，既不承擔(dān)風(fēng)險，又不卷入合同雙方的爭端。
2、有條件(Conditional)銀行保函。
銀行在支付之前，業(yè)主必須提出理由，指出承包商執(zhí)行合同失敗、不能履行其業(yè)務(wù)或違約，并由業(yè)主或監(jiān)理工程師出示證據(jù)，提供所受損失的計算數(shù)據(jù)等。
一般來講，銀行不愿意承擔(dān)這種保函，業(yè)主也不喜歡這種保函。
履約擔(dān)保書的擔(dān)保方式是:
當(dāng)承包人在履行合同中違約時，開出擔(dān)保書的擔(dān)保公司或者保險公司用該項擔(dān)保金去完成施工任務(wù)或者向發(fā)包人支付該項保證金。工程采購項目保證金提供擔(dān)保形式的，其金額一般為合同價的30%一50%。承包人違約時，由工程擔(dān)保人代為完成工程建設(shè)的擔(dān)保方式，有利于工程建設(shè)的順利進行，因此是我國工程擔(dān)保制度探索和實踐的重點內(nèi)容。
區(qū)別總結(jié)：
一、含義不同。
履約保函：指的就是應(yīng)勞務(wù)方以及承包方的請求，銀行金融機構(gòu)向工程的業(yè)主方做出一種履約保證承諾。
履約保證金：指的就是工程發(fā)包人為了防止承包人在合同執(zhí)行過程當(dāng)中違反合同當(dāng)中的規(guī)定，并且也不給發(fā)包人造成的經(jīng)濟損失，其形式有履約保證金及履約銀行保函和履約擔(dān)保書三種履約擔(dān)保金，可以用于保兌支票以及銀行匯票或者是現(xiàn)金支票。
二、出具單位不同。
履約保函：出具單位是銀行出具
履約擔(dān)保書：一般由擔(dān)保公司出具。
三、擔(dān)保金額不同。
履約保函：擔(dān)保金額為合同價款10%。
履約擔(dān)保書：擔(dān)保金額為合同價款30%左右。
辦理履約保函有兩種方式：
1、通過銀行直接辦理，此時需要存入全額保證金，另付銀行費用。
①申請履約保函：申請人向銀行提交申請，并提供所需的資料和文件。
②調(diào)查和審查：銀行會對申請人進行調(diào)查和審查，包括審核申請人的信用狀況、財務(wù)狀況以及履約能力。
③簽訂協(xié)議繳納保證金：在履約保函辦理過程中，申請人和銀行會簽訂一份協(xié)議，明確雙方權(quán)利和義務(wù)。通常要求申請人提供一定比例的履約保證金或者反擔(dān)保，作為保函的信用支持。
④開立履約保函：經(jīng)過審核和協(xié)議簽訂后，銀行會開立履約保函。履約保函是銀行向收益人(通常為業(yè)主或買方)發(fā)出的承諾，保證在申請人不履行合同義務(wù)時承擔(dān)責(zé)任并給與賠償。
2、通過擔(dān)保公司辦理，擔(dān)保公司為客戶向銀行提供反擔(dān)保，銀行即可不收(或者部分收取)客戶保證金辦理保函，客戶另付擔(dān)保公司費用。
銀行在收取保證金時，會考慮項目是建筑安裝服務(wù)類，有對應(yīng)的建設(shè)局頒發(fā)的一級及以上資質(zhì)作為支撐，可以申請免保證金。
項目為市政工程，有與項目對應(yīng)的建設(shè)局頒發(fā)二級以上資質(zhì)作為支撐，可以申請免保證金。
資質(zhì)為3級或無資質(zhì)，一般不能免保證金，只能部分免除。
項目是采購供貨類，一般是沒有對應(yīng)的資質(zhì)的，所以不能免保證金。
項目和公司條件雖然沒有達到銀行的免保要求，但是保函的有效期短，或者項目風(fēng)險可控，可以申請免除保證金的。