北京協(xié)和醫(yī)院創(chuàng)新性提出了“待病人如親人，提高病人滿意度；待同事如家人，提高員工幸福感”的辦院理念；提煉出了“學(xué)術(shù)、品質(zhì)、人文”的百年協(xié)和內(nèi)涵；推進(jìn)醫(yī)療服務(wù)體系、人才培養(yǎng)體系、科技創(chuàng)新體系、精細(xì)管理體系、開放協(xié)作體系、黨建文化體系等“六大體系”建設(shè)。
曾學(xué)軍教授在多項首發(fā)基金連續(xù)十年支持下開展大型綜合醫(yī)院與社區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)合作模式的研究。2005年始主持《社區(qū)中老年人健康管理規(guī)范》的制訂和推廣，成為國家公共衛(wèi)生規(guī)范項目之一，并于2015年成為國家推薦標(biāo)準(zhǔn)。
在醫(yī)療實踐的同時，曾學(xué)軍教授致力于臨床醫(yī)學(xué)教育，任美國內(nèi)科醫(yī)師學(xué)會（ACP）Fellow、美國醫(yī)學(xué)研究所（IOM）中國醫(yī)學(xué)教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫(yī)師心中好老師”、北京市師德先進(jìn)個人、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院教學(xué)名師等榮譽(yù)，帶領(lǐng)普通內(nèi)科獲得2015年北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院教學(xué)團(tuán)隊稱號。2019年2月入選十大社區(qū)健康促進(jìn)首 席專家。
近年來，得益于國家對風(fēng)濕免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撐計劃/863項目、自身免疫性疾病新藥臨床評價研究技術(shù)平臺科技重大專項、衛(wèi)計委行業(yè)科研專項等支持下，以北京協(xié)和醫(yī)院牽頭，聯(lián)合全國近800家風(fēng)濕病診治中心，已初步形成系統(tǒng)性紅斑狼瘡研究協(xié)作組（CSTAR）和國家風(fēng)濕病數(shù)據(jù)中心（CRDC）的研究網(wǎng)絡(luò)，成為國內(nèi)的風(fēng)濕病研究協(xié)作組織，創(chuàng)建了中國風(fēng)濕病信息數(shù)據(jù)庫、生物樣本庫（CRIP）和規(guī)范化培訓(xùn)和多學(xué)科交流平臺（CREP），啟動了中國風(fēng)濕病學(xué)界的多中心協(xié)作研究，發(fā)布了中國風(fēng)濕病學(xué)界的規(guī)范化診治共識。