目前，北京協和醫院共有4個院區、總建筑面積62萬余平方米，在編職工4300余人、兩院院士3人、臨床醫技及平臺科室59個、國家臨床重點專科29個、科研平臺6個、國家“雙”建設學科5個、國家重點學科12個、一級學科博士學位授權點9個、繼續醫學教育基地6個、國家住院醫師規范化培訓專業基地21個、國家專科醫師規范化培訓試點基地8個。開放住院床位2000余張，2023年手術量7.3萬例、年出院病人13萬人次。先后獲“全國文明單位”“全國衛生系統先進集體”“全國先進基層黨組織”“全國抗擊新冠肺炎先進集體”等稱號。同時，醫院還承擔著支援欠發達地區、國家重要活動醫療保障和突發事件主力醫療隊的重任。
曾學軍教授在多項首發基金連續十年支持下開展大型綜合醫院與社區醫療機構合作模式的研究。2005年始主持《社區中老年人健康管理規范》的制訂和推廣，成為國家公共衛生規范項目之一，并于2015年成為國家推薦標準。
近年來，得益于國家對風濕免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撐計劃/863項目、自身免疫性疾病新藥臨床評價研究技術平臺科技重大專項、衛計委行業科研專項等支持下，以北京協和醫院牽頭，聯合全國近800家風濕病診治中心，已初步形成系統性紅斑狼瘡研究協作組（CSTAR）和國家風濕病數據中心（CRDC）的研究網絡，成為國內的風濕病研究協作組織，創建了中國風濕病信息數據庫、生物樣本庫（CRIP）和規范化培訓和多學科交流平臺（CREP），啟動了中國風濕病學界的多中心協作研究，發布了中國風濕病學界的規范化診治共識。
北京協和醫院風濕免疫科的患者90%以上來自外地，患者大多面臨疾病折磨和輾轉求診的雙重困難。為此，科里的醫生們連續多年保持的門診量，以滿足廣大風濕病患者的迫切就醫需求。