先后承擔2項國家自然科學基金重點項目，國家“863”計劃、國家“973”計劃課題組長、重大新藥創制等課題多項；獲國家發明專利授權4項，國際專利（德國、美國）授權2項，申請國家發明專利3項；發表SCI論文34篇，或通訊作者29篇，影響因子146.837；主編專著四部；先后獲國家科技進步二等獎2項、省部級科技一等獎3項，二等獎1項。
長期從事風濕臨床免疫基礎和臨床研究。首次發現：新生抗原介導了強直性脊柱炎發病，是該領域里程碑式重大發現（Science，2023）；類風濕關節炎滑膜中鐵死亡機制；CD147是病毒和瘧原蟲入侵人體新受體。研發成功抗惡性瘧疾和重癥新冠病毒感染特異創新；建立了炎性關節炎內外科綜合診療關鍵技術體系，首先提出“AS合并髖關節炎MRI評估標準”，主持建立《ANCA檢測技術》和《中軸型脊柱關節炎綜合評估》中國專家共識。
1993年12月，時任傳染科副主任醫師、副教授的朱平已在傳染病領域積累了豐富的臨床經驗，關于流行性出血熱發病機制的研究項目獲得軍隊科技進步二等獎，但她毅然服從醫院發展需要的安排，調任至彼時“一窮二白”的免疫科，從頭做起。
多年來，朱平始終把敬佑生命、救死扶傷作為行醫使命。她堅持運用前沿創新理論指導臨床，不斷提升急危重癥及疑難雜癥患者救治率；她待患若親，以仁愛之心服務每一位患者。