近年在國內外主要刊物發表論文多篇、獲國家發明專利2項，國家科技進步一等獎，軍隊科技進步一，二等獎各一項。
朱平教授從醫執教33年，在疑難、重癥風濕免疫病患者的救治方面積累了豐富的經驗，長期從事類風濕關節炎等風濕免疫性疾病的免疫介導機制和診斷新技術的研究，創建了10余項新技術、新業務，其中4項屬于國內水平：（1）免疫新療法和新制劑的臨床和臨床基礎研究；（2）炎性關節病的內外科綜合診療技術；（3）篩選臟器損傷的預警指標指導早期診斷；（4）研究并建立健康和疾病時免疫狀態診斷和評估體系。牽頭或參加多中心臨床研究28項。建立了CD147分子介導類風濕關節炎損傷和抗損傷的功能研究體系，獲得了CD147及其配體的結合位點，為研究新藥奠定了重要基礎。
長期從事風濕臨床免疫基礎和臨床研究。首次發現：新生抗原介導了強直性脊柱炎發病，是該領域里程碑式重大發現（Science，2023）；類風濕關節炎滑膜中鐵死亡機制；CD147是病毒和瘧原蟲入侵人體新受體。研發成功抗惡性瘧疾和重癥新冠病毒感染特異創新；建立了炎性關節炎內外科綜合診療關鍵技術體系，首先提出“AS合并髖關節炎MRI評估標準”，主持建立《ANCA檢測技術》和《中軸型脊柱關節炎綜合評估》中國專家共識。
1993年12月，時任傳染科副主任醫師、副教授的朱平已在傳染病領域積累了豐富的臨床經驗，關于流行性出血熱發病機制的研究項目獲得軍隊科技進步二等獎，但她毅然服從醫院發展需要的安排，調任至彼時“一窮二白”的免疫科，從頭做起。
朱平瞄準世界醫學前沿，對接當時國際科研發展和疑難危重病診治需求，將研究重點鎖定在了剛剛興起的風濕免疫專業，及時引進醫院臺代表當時國際水平的流式細胞儀，在臨床研究中開展免疫活性細胞定量和功能分析技術，為患者診斷、、預后評估、不良反應監測等提供重要幫助。