現有的檔案柜（架）大都未給此種擺放方式留下足夠的空間，因此選用橫式檔案盒時應同時考慮檔案柜（架）的狀況。機關單位在選用檔案盒時，兩種格式的檔案盒只能選用一種，以簡便管理、保證檔案盒上架后整齊、美觀。
實踐中存在將盒號功能擴大化的傾向：
一是在歸檔章上增加盒號項目或將盒號標注于歸檔文件首頁，將盒號作為歸檔文件與檔案盒之間關聯關系的紐帶；
二是在電子文件整理中，為實現與紙質文件材料形式上一致，存在把盒作為整理單位，將電子文件以盒為單位進行整理的現象，這兩種做法與盒號承載的功能都是相悖的。
實際上，在歸檔文件的件號已經與盒脊起止件號建立關聯關系的情況下，沒有必要再通過盒號，在歸檔文件與檔案盒之間建立第二套關聯關系。否則既成倍增加了工作量，有可能出現兩套關聯關系指向不一的情況，增加管理的復雜性。
檔案盒盒脊可以根據機關單位的實際需要，與歸檔章項目相協調，編制其他項目。增減項目的工作應在同級檔案行政管理部門的指導下進行。機關檔案部門可對欄目位置及尺寸進行一定的調整，以規范、美觀為原則。
檔案盒的制成材料
從檔案保護的目的出發，檔案盒應采用無酸紙制作，以避免長期保存時檔案盒紙板中的酸性物質影響盒內文件壽命。各級檔案行政管理部門應從本地實際情況出發，積極推廣無酸紙的應用，以杜絕檔案盒制作材料方面存在的隱患。
檔案是對某件事或某個人的經歷過程的記錄，是為了方便以后查閱，保存期限一般都在十年以上，所以要加強其保管工作，目前在檔案保管工作中遇到很多問題，如出現紙張老化、字跡模糊、檔案蟲害等，損壞了不少重要的檔案，無酸紙檔案盒解決了這一難題，它可以長期存放不發霉變質，還可以防蟲害，這也是國家檔案局推廣使用的檔案盒類型。