頭一步，準備好清掏設備(如：吸污吸糞車)；
第二步，用鐵鉤打開化糞池的蓋板，再用長的桿子(如竹桿)攪散化糞池內雜物結塊層；
第三步，套好吸污車的吸糞膠管放入化糞池內；
第四步，啟動吸糞車的開關，吸出糞便直至化糞池內的化糞結塊物吸完為止，防止弄臟工作現場和過往行人的衣物；
第五步，化糞池內的沉淀物清理完畢后，蓋好化糞池井蓋，用清水沖洗工作現場和所有工具。
很多化糞池都是歷經多年從未清理過，導致里面沉淀物都滿了，從而化糞池自然就用不了，這時就需要請專業的管道清洗公司來進行一次性化糞池清底，把化糞池徹底清除干凈，也可定期進行維保，間隔一段時間讓專業公司來抽取漂浮物進行維保。
化糞池需要定期打開蓋子進行清理抽糞，一般不要建長久性建筑，特別是不能壓住蓋子，可以做一些綠化。其結構很簡單，就是磚砌的一個大池子，現在也有玻纖成品的，一般成圓柱形 。